Minería de patrones frecuentes para la comprobación de las reglas de Susumu Ohno y su uso en la identificación de evolución de organismos biológicos

Luis H. García-Islas; Anilu Franco-Arcega; Antonio Quiroz-Gutierrez; Kristell D. Franco-Sanchez

doi:10.29057/icbi.v7i13.4253

Luis H. García-Islas Universidad Autónoma del Estado de Hidalgo
Anilu Franco-Arcega Universidad Autónoma del Estado de Hidalgo
Antonio Quiroz-Gutierrez Universidad Autónoma del Estado de Hidalgo
Kristell D. Franco-Sanchez Universidad Autónoma del Estado de Hidalgo

DOI: https://doi.org/10.29057/icbi.v7i13.4253

Palabras clave: Minería de datos, Patrones Frecuentes, Cadenas de Markov, ADN, Bioinformática

Resumen

Con el desarrollo de la bioinformática, la búsqueda de patrones frecuentes en secuencias de ADN se ha vuelto un punto de atención crítico. Los patrones de secuencia biológicos, especialmente patrones que se repiten, usualmente reflejan alguna característica funcional o estructural importante. Como resultado de varios estudios, Susumu Ohno propuso una serie de reglas que las secuencias de ADN deben cumplir para la propia evolución de esos organismos biológicos. El presente trabajo realizó una validación de dichas reglas basándose en técnicas de minería de datos y cadenas de Markov evaluando 32,074 secuencias de ADN de diversos organismos biológicos obtenidos de la base de datos biológica del repositorio GenBank, perteneciente al Centro Nacional de Información de Bioinformática del departamento de salud de Estados Unidos, y con lo cual se pudo identificar organismos que poseen particularidades que pueden diferenciarlos en su evolución.

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